根据最近的一项区域贸易分析，各国政府已就重要政策达成一致，但推迟了实施。因此东非共同体成员国经常违反《共同市场议定书》，通过施加非关税贸易壁垒(NTBs)和反复要求特殊税收待遇和豁免来违背区域一体化目标。
根据东非商业理事会(EABC)的EAC内部贸易简要分析报告，EAC成员国之间的贸易额从2021年的54亿美元下降到2022年的36亿美元，降幅超过33%(18亿美元)。
《东非》(the EastAfrican)是一家专注于东非新闻报道的新闻出版物，该出版物获得的研究报告显示，谷物贸易同期从6.072亿美元暴跌至2.855亿美元，矿物燃料贸易从6.182亿美元降至1.751亿美元，这对东非共同体内部贸易的影响最大。高粱和大米贸易下降，但玉米出口猛增63%，从1.146亿美元增至1.871亿美元。
据EABC称，阻碍区域商业繁荣的其他重大障碍包括限制性贸易做法、无法全面实施新的共同对外关税(CET)、经营成本高、过度依赖外汇以及雨养农业。
其他包括全球冲击的连锁反应，这些冲击阻碍了小麦、汽油和化肥等基本商品的供应，从而加剧了粮食不安全。
肯尼亚制造商协会(KAM)批评肯尼亚2022年取消食用油进口关税的决定，这违反了东非共同体的共同对外关税准则。
为了结束伙伴国家频繁使用申请延期，并鼓励区域内的商业、投资和就业增长，东亚经济共同体建立了新的四频段关税制度，该制度于2022年7月1日生效。
根据修订后的关税制度，在东非共同体地区没有的中间项目须缴纳10%的税。同时资本货物和原材料免征进口税。虽然进口制成品须缴付35%的进口税，但可在区域内取得的中间产品则须缴付25%的关税。
敏感商品的关税高于35%。根据东非共同体秘书处的数据，对成品征收35%的税有可能使东非共同体内部贸易增加1890万美元，创造6781个就业岗位，并使东非共同体的税收增加5.5%。
8月31日至9月1日东非经济共同体将在坎帕拉举行论坛，以促进区域一体化和扩大东非经济共同体内部贸易。它将动员反对取消贸易和投资限制。例如由于生产成本降低，乌干达牛奶在肯尼亚更便宜，这促使约约韦里·卡古塔·穆塞韦尼总统的政府在北非和西非寻找新的市场。
在税收优惠方面，几乎所有EAC成员国都希望获得税收优惠以保护本国产业。例如坦桑尼亚要求推迟实行50%的地区CET比率。Dar将继续对古织物征收35%的关税一年，而乌干达同样将推迟零关税，并对手机征收10%的关税一年。
另一方面肯尼亚将继续使用EAC 0%的CET税率，并对手机征收25%的税率为期一年。
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