非洲妇女在非洲内部和区域贸易中面临的一些独特挑战，包括获得生产性资源和资金的机会有限；两性工资差距使妇女长期从事低生产率活动；经济领域，包括工作场所、市场等地的性骚扰和基于性别的暴力；在无偿护理和家务劳动中所承担的责任过大；有偏见的社会规范导致流动性和时间限制，造成时间贫困，可用于经济和贸易活动的时间有限。
其他挑战包括对出口市场机会和融入区域价值链的方法了解有限，生产增值产品和服务、以有竞争力的价格获得投入的能力有限，以及在遵守管理要求以及安全和质量标准方面的挑战。性别数字鸿沟被视为一个关键的潜在挑战，限制了妇女获得信息和参与非洲内部以及区域贸易的能力。
对许多妇女来说，非洲内部和区域贸易带来了经济赋权和更高的收入。在非洲国家，妇女积极参与农业、制造业（服装和纺织品）和服务业等部门工作。贸易机会使更多的家庭资源处于妇女的控制之下，这反过来又对后代保健和教育的总体投资产生了积极影响。
但是，妇女也在其他几个部门大量就业，这些部门由于贸易自由化而继续经历调整和变化，如农业和纺织业。需要做更多的工作来了解妇女在贸易调整中的表现是否存在差异。
据估计，非洲70%的非正规跨界贸易是由女商人进行的。妇女处于有利地位，是非洲经济增长加速器的未开发资源，特别是根据《妇女和青年贸易议定书》。据估计，非洲内部贸易目前为非洲大陆总人口的43%左右提供了收入，但非洲内部贸易仅占非洲大陆贸易总额的10%多一点。根据非洲开发银行2019年的报告，东非的区域贸易仅占2017年贸易总额的8.3%，低于非洲大陆平均水平，并且在过去五年中基本没有变化。
联合国妇女署与非洲大陆自由贸易区（AfCFTA）和AfCFTA秘书处的区域机构合作，解决（年轻）妇女在贸易时面临的挑战，并通过以下方式在非洲内部贸易的未来中更加坚定地定位她们：
- 共同召开关于妇女和青年参与贸易的大陆会议
- 通过倡导在整个价值链中对（年轻）妇女的经济赋权、技能建设和（年轻）妇女领导的中小企业进行更多投资，以便她们能够竞争并从区域一体化和非洲内部贸易中获益
- 通过创造有关（年轻）贸易妇女所面临的挑战的知识
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