乌干达的进口增长速度一直快于出口。截至2022年，该国的贸易逆差达到47.7亿美元，比2021年的41.1亿美元增长了16%。
贸易逆差可能会导致本币贬值，最终有望通过提高出口产品对进口产品的竞争力来弥补同样的逆差。乌干达的出口没有足够的竞争力。
尽管政府采取了各种措施来促进出口，但增长仍然低迷。这是一个令人担忧的原因，因为持续的贸易逆差可能会因汇率波动、外债积累、过度依赖进口而容易受到全球冲击而产生通胀压力。
克服贸易逆差可能需要内向型和外向型战略相结合的政策。乌干达已经颁布了几项政策来帮助推动出口，例如2015/16-2019/20国家出口发展战略，该战略提出了一些干预措施来解决乌干达出口部门的制约因素。它包括以产品和市场为重点，增加产量，增值，质量保证和产品竞争力等等。此外政府通过“购买乌干达，建设乌干达”倡议，促进国内消费国内生产的商品，以减少对进口的依赖。
然而进出口差距继续扩大。尽管如此，自2016年以来，除2020/21财年外，乌干达在东非共同体内部的贸易中取得了贸易顺差。乌干达2023年7月的月度经济表现报告显示，东非共同体仍然是乌干达最大的出口目的地。
肯尼亚、南苏丹和刚果民主共和国是乌干达商品出口的前三大目的地，分别占出口总额的31.4%、25.7%和24.7%。
然而对该地区的出口也不能免受进口压力的影响。乌干达统计局(UBOS)的年度数据显示，尽管与其他成员国相比，肯尼亚和坦桑尼亚的潜在市场更大，但该国与这两个国家的贸易一直存在逆差。乌干达对卢旺达的出口受到两国边境关闭近两年的口角的严重影响。
除了采取措施维护南苏丹、布隆迪和刚果民主共和国的贸易顺差外，还需要仔细检查该国与邻国的关系。
跨境贸易争端，特别是在南苏丹、卢旺达和肯尼亚，曾多次使乌干达贸易商陷入困境，因为他们被指控产品不合格。这不仅使受影响的贸易商蒙受损失，而且还威胁到该国在东非共同体集团内的注册贸易成功和地位。
政府应该通过外交使节部、产业通商合作部、东非部，寻找解决矛盾的方法，使贸易顺利进行。
乌干达国家标准局(UNBS)应进行产品认证，并强制乌干达出口商严格遵守标准，以减少因声称产品不合格而产生的贸易冲突。此外，政府应支持企业建立品牌认知度，从而鼓励个人通过生产和出口高质量产品来维护自己的声誉。
肯尼亚是乌干达在欧盟内最大的出口目的地，因此两国需要继续对话，放宽对乌干达的农产品(包括牛奶、家禽产品、糖和玉米)的非关税壁垒。
在过去的5个财政年度里，乌干达与坦桑尼亚的贸易出现逆差，在2020/21财年达到了11亿美元的峰值。坦桑尼亚是东非共同体中人口最多的国家，这意味着乌干达的出口有更大的潜在市场。与肯尼亚一样，坦桑尼亚有时也对乌干达农产品设置贸易壁垒。在两国就取消贸易壁垒进行谈判的同时，应该寻求更多的途径来利用潜在的巨大市场，以促进乌干达从坦桑尼亚的出口。
乌干达需要以提高企业生产和出口能力为目标的政策，例如鼓励创新、采用更好的生产技术、获得廉价信贷、简化商业正规化过程等措施。这将促进当地的出口生产。
乌干达应该解决标准问题。应协助中小微企业(MSMEs)遵守EAC集团内贸易便利化的标准。尽管坦桑尼亚有巨大的潜在市场，但该国持续的巨额赤字要求采取额外的出口促进战略，以增加乌干达从达累斯萨拉姆获得的收入。
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