“十三五”以来，云南省落实落细扶持政策，畜牧业发展取得显著成效。2020年，全省畜牧业总产值2315.4亿元，较“十二五”末翻了一番，全国排名由第12位提升到第5位，畜牧业大省的地位进一步巩固。
全省区域布局和产品结构进一步优化，综合生产能力稳步提升，转型升级步伐明显加快。省农业农村厅提供数据显示，2020年，全省肉类总产417.4万吨，较“十二五”末增10.3%，居全国第6位；禽蛋产量41.8万吨，较“十二五”末增60.7%；牛奶产量67.3万吨，较“十二五”末增22.4%。生猪存栏3120.4万头、出栏3453.2万头，均居全国第4位，生猪存栏同比增33.2%、高于全国平均增长水平2.2个百分点，恢复至2017年度的103%、高于全国平均恢复度11个百分点，圆满完成国家下达的任务目标；肉牛存栏810.4万头、出栏335.9万头，分别居全国第1位、第4位；肉羊存栏1350.7万只、出栏1177.5万只，均居全国第8位；家禽存栏1.9亿羽、出栏3.4亿羽。
曲靖市、红河哈尼族彝族自治州、昭通市、保山市4个州市生猪存栏占全省的比重由“十二五”末的49%提高到52%，产业集中度显著提升。全省牛羊禽肉产量占肉类总产量的比重由“十二五”末的23%提高到30%，优质畜产品市场竞争力持续增强。规模养殖水平进一步提升，全省畜禽养殖综合规模化率达40%，较“十二五”末提高18个百分点。畜禽种业自主创新水平稳步提高，培育出宣和猪、云上黑山羊两个畜禽新品种。屠宰行业标准化生产能力稳步提升，大型屠宰企业数量由“十二五”末的10家增加到24家。
近年来，云南省质量兴牧扎实推进，源头治理、过程管控、产管结合等措施全面推行，畜产品质量安全持续向好，绿色发展取得重大进展。2020年饲料、兽药投入品抽检合格率分别达到98.7%、93.7%。畜产品抽检合格率常年保持在98%以上，生鲜乳违禁添加物连续15年保持“零检出”，居全国前列。全省没有发生重大畜产品质量安全事件，畜产品质量安全呈现总体可控、稳步向好的态势。
同时，云南省全面完成畜禽养殖禁养区划定，开展规模养殖场治理，全省划定禁养区4968片、5.29万平方公里。建立病死畜禽无害化处理长效机制，建成病死畜禽专业无害化处理场点170个，年处理能力达100万头。统筹抓好畜牧产业发展、畜禽养殖废弃物综合利用、畜产品安全管理、重大动物疫病防控等工作，初步形成了生态高效、种养循环、绿色发展的新格局。2020年，全省畜禽粪污综合利用率达到80.7%，规模养殖场粪污处理设施装备配套率达95.7%，其中大型规模养殖场粪污处理设施装备配套率达100%。
